- Khám, cấp cứu và thu dung điều trị cho các đối tượng bệnh nhân là quân nhân tại chức, đối tượng chính sách, bảo hiểm quân, bảo hiểm quân hưu trí, bảo hiểm dân và nhân dân thuộc diện thu một phần viện phí.
- Tham gia bảo vệ và chăm sóc sức khoẻ cán bộ cấp Sở Ban ngành trực thuộc tỉnh, thành phố trên địa bàn và làm nhiệm vụ quốc tế với Quân đội Hoàng gia Camphuchia.
- Bảo đảm nhân lực chuyên môn đồng thời là cơ sở điều trị tuyến sau của Quân y thuộc các đơn vị biển đảo (Phú Quốc, Thổ Chu) và sẵn sàng hỗ trợ theo yêu cầu của ngành Y tế trong chiến lược phát triển y tế biển đảo.
- Quản lý Trung tâm huấn luyện cán bộ y tế Quân khu 9 thực hiện việc tổ chức đào tạo cán bộ y tế trong khu vực.
- Quản lý Nhà tang lễ Quân khu 9.
